La polyculture et la co-culture sont bien des formes d'IMTA.

La co-culture est l'association de deux espèces comme ce que teste en ce moment en France sur les cotes  bretonnes les conchyliculteurs avec le CEVA : projet Breizh'Alg (macroalgues et bivalves)

La polyculture est l'association de plusieurs (>2) espèces qui permettent d'améliorer le rendement d'un système d'élevage. L'exemple le plus connu en France est la polyculture extensive en étang (4 ou 5 variétés de carpes peuvent valoriser les différentes ressources trophiques d'un étang piscicole).

L'IMTA moderne d'aujourd'hui est le plus souvent l'association d'une espèce noyau (aquaculture intensive poisson) et de plusieurs espèces associées qui vont réutiliser les déchets de cette aquaculture intensive (CO2, nutriments azotés et phosphorés, matière organique détritique) comme par exemple microalgues, macroalgues, vers polychètes, bivalves, poissons herbivores (mulets), etc.

On peut encore ajouter à cela l'aquaponie. L'aquaponie est la culture de végétaux produits en « symbiose » avec l'élevage de poissons. Ce sont les déjections des poissons qui servent d'engrais pour le végétal cultivé. Le mot aquaponie, traduction de l'anglais "aquaponics", est la contraction des mots aquaculture (élevage de poissons ou autres organismes aquatiques) et hydroponie (culture de plantes par de l'eau enrichie en matières minérales).

Pour plus de détail voir aussi sur Wikipedia :
http://en.wikipedia.org/wiki/Integrated_Multi-trophic_Aquaculture